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ADMETlab: 一个全面优秀的药物ADMET性质预测平台

药物ADMET虚拟预测评价是药物开发中的一个重要环节,近些年除了一些人工智能的模型之外,还发展了一系列的工具和软件。今天介绍中南大学曹东升课题组董界等人开发的ADMET预测平台。该平台提供目前最大最全面药物ADMET数据库和多达31种ADMET终点性质的系统评估,在国内外相关领域迅速获得广泛应用,成果短期被引用上百次。平台地址:http://admet.scbdd.com

药物ADMET虚拟预测评价是药物开发中的一个重要环节,近些年除了一些人工智能的模型之外,还发展了一系列的工具和软件。今天介绍中南大学曹东升课题组董界等人开发的ADMET预测平台。该平台提供目前最大最全面药物ADMET数据库和多达31种ADMET终点性质的系统评估,在国内外相关领域迅速获得广泛应用,成果短期被引用上百次。平台地址:http://admet.scbdd.com

1.简介

当前的药物研发(R&D)是一项高风险的投资,在药物发现的不同阶段通常会面临一些意想不到的甚至灾难性的失败。其中,药物研发失败的一个主要原因就是功效和安全性缺陷,这在很大程度上与吸收、分布、代谢和排泄 (ADME) 特性和各种毒性 (T) 相关。因此,迫切需要快速的 ADMET 评估以最大限度地减少药物发现过程中的失败。在这里,作者开发了一个名为 ADMETlab 的基于网络的平台,用于基于由 288,967 个条目组成的全面收集的 ADMET 数据库对化学品进行系统的 ADMET 评估。平台中的四个功能模块使用户可以方便地进行六种药物相似性分析(类药性规则),31 ADMET 终点预测(基本属性:3,吸收:6,分布:3,代谢:10,消除:2,毒性:7),系统评估和数据库/相似性搜索。该网络平台有望通过实现早期药物相似性评估、快速 ADMET 虚拟筛选或过滤和化学结构的优先级排序来促进药物发现过程。ADMETlab Web 平台基于 Python 中的 Django 框架设计,可在 http://admet.scbdd.com/ 上免费访问。

图1. ADMETlab示意图

2. 主要特点

  • 大多数属性的比较大型数据集。
  • 更好、更稳健的 SAR/QSAR 模型。
  • 系统分析比较
  • 为分子优化提供建设性建议
  • 批量计算
  • 用户友好的界面

3. 主要功能

ADMETlab可以帮助研究人员、PK专家做到以下几点:

  • 药物相似性分析。
  • ADME/T 评估。
  • 基于 ADME/T 数据库的相似性搜索。
  • 系统的 ADME/T 评估。
图2. ADMETlab涵盖的性质

参考文献

原创文章,作者:ifyoung,如若转载,请注明出处:https://www.drugfoodai.com/admetlab.html

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